[dennou-ruby:003992] Re: gphysとruby-fftw3のインストール失敗

[Yuta Nakagawa <nakagawa@xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx>]

西澤様

ありがとうございます。
なるほど、そうだったのですね。
4行目を書き換えてリトライしたところ、
gphysがインストールできました。

晴れてテストにgpviewを...と思ったのですが動かず、
(numru-miscとnumru-unitがちゃんとインストールされていなかったことと、
LD_LIBRARY_PATHにnetcdf関連のパスがなかったことを改善しましたが、)

[nakagawayuta@localhost p04-exp]$ gpview Temp.nc 
 *** MESSAGE (SWDOPN) ***  GRPH1 : STARTED / IWS =  1.                         
/usr/bin/gpview:854:in `gropn': [SWDOPN] BITMAP FILE DOES NOT EXIST. (RuntimeError)
	from /usr/bin/gpview:854:in `<main>'
[nakagawayuta@localhost p04-exp]$

というエラーを解決できません。
申し訳ありません、こちらについてもよろしいでしょうか...
よろしくお願いいたします。

中川雄太

----- Original Message -----
>> From: Seiya Nishizawa <seiya@xxxxxxxxxxxxxx>
>> To: Dennou-ruby <dennou-ruby@xxxxxxxxxxx>
>> Date: 2016-12-07 17:44:11
>> Subject: [dennou-ruby:003991] Re: [dennou-ruby:003990] Re: gphysとruby-fftw3のインストール失敗
>> 
>> 西澤です
>> 
>> 最近は gphys も gem で入れることが想定されていて、
>> このあたりはメンテされてないですね(webページの記述も古いです)。
>> 4行目を
>> $rb_18 = true
>> としてみてください。
>> 
>> 
>> 西澤誠也
>> 
>> 
>> 2016年12月7日 17:22 Yuta Nakagawa <nakagawa@xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx>:
>> > 西澤様
>> >
>> > ありがとうございます。
>> > (i)まずruby-fftw3ですが
>> > gem install ruby-fftw3 -- with-narray-include=(narray.hのパス)
>> > としたところ、
>> > ...
>> > /usr/bin/ld: /usr/local/lib/libfftw3.a(apiplan.o): 再配置 R_X86_64_32S (`.rodata' に対する) は共有オブジェクト作成時には使用できません。-fPIC を付けて再コンパイルしてください。
>> > /usr/local/lib/libfftw3.a: シンボルを読み込めませんでした: 不正な値です
>> > collect2: エラー: ld はステータス 1 で終了しました
>> > make: *** [fftw3.so] エラー 1
>> > ...
>> > と返ってきたので、fftw3のCFLAGSを-fPICに指定してインストールし直し、再度
>> > [nakagawayuta@localhost work]$ gem install ruby-fftw3 -- with-narray-include=/usr/local/lib64/ruby/site_ruby
>> > Fetching: ruby-fftw3-1.0.2.gem (100%)
>> > Building native extensions with: 'with-narray-include=/usr/local/lib64/ruby/site_ruby'
>> > This could take a while...
>> > Successfully installed ruby-fftw3-1.0.2
>> > Parsing documentation for ruby-fftw3-1.0.2
>> > unable to convert "\xC0" from ASCII-8BIT to UTF-8 for ext/numru/fftw3/fftw3.so, skipping
>> > unable to convert "\x89" from ASCII-8BIT to UTF-8 for ext/numru/fftw3/na_fftw3.o, skipping
>> > Installing ri documentation for ruby-fftw3-1.0.2
>> > 1 gem installed
>> > [nakagawayuta@localhost work]$
>> > ということで無事インストールできました、ありがとうございます。
>> >
>> > (ii)gphysについて
>> > Config->RbConfig
>> > とおきかえてみますと、エラー該当部分が
>> > /usr/share/rubygems/rubygems/core_ext/kernel_require.rb:55:in `require': cannot load such file -- ftools (LoadError)
>> >         from /usr/share/rubygems/rubygems/core_ext/kernel_require.rb:55:in `require'
>> >         from install.rb:8:in `<main>'
>> > となりました。しかしftoolsというファイルは存在しないようです。
>> >
>> > もう一つ疑問があるのですが、
>> > どうしてgphysのトップディレクトリでなくext/numru/gphysにextconf.rbがあるのでしょうか
>> > （http://ruby.gfd-dennou.org/products/gphys/ ではトップにあるように思えます）。
>> >
>> >
>> > ----- Original Message -----
>> >>> From: Seiya Nishizawa <seiya@xxxxxxxxxxxxxx>
>> >>> To: Dennou-ruby <dennou-ruby@xxxxxxxxxxx>
>> >>> Date: 2016-12-07 10:22:52
>> >>> Subject: [dennou-ruby:003989] Re: [dennou-ruby:003988] gphysとruby-fftw3のインストール失敗
>> >>>
>> >>> 中川さん
>> >>>
>> >>> gphys ですが、ログに
>> >>> install.rb:3:in `<main>': Use RbConfig instead of obsolete and
>> >>> deprecated Config.
>> >>> とあるので、
>> >>> 3行目の
>> >>> include Config
>> >>> を
>> >>> include RbConfig
>> >>> に変えてみてはどうでしょうか?
>> >>>
>> >>>
>> >>> ruby-fftw3 ですが、
>> >>> 環境変数 NARRAY_TYPE は設定せずに、
>> >>> gem install ruby-fftw3 -- with-narray-include=(narray.hのパス)
>> >>> とするといけますか？
>> >>>
>> >>>
>> >>> 西澤誠也
>> >>>
>> >>> 2016年12月3日 16:39 Yuta Nakagawa <nakagawa@xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx>:
>> >>> > 皆様、
>> >>> >
>> >>> > 初めまして、中川です。
>> >>> > ただいまgphysのインストールを目指していますが、
>> >>> > 本体とそのライブラリの1つruby-fftw3とがインストールできません。
>> >>> >
>> >>> > エラーのログファイルを添付します。
>> >>> > 環境は
>> >>> > CentOS Linux 7.2.1511
>> >>> > gcc バージョン 4.8.5 20150623 (Red Hat 4.8.5-4) (GCC)
>> >>> > ruby 2.0.0p598 (2014-11-13) [x86_64-linux]
>> >>> > です。
>> >>> >
>> >>> > よろしくお願いいたします。
>> >>> >
>> >>> > 中川雄太
>> >>> > 東京大学大学院 理学系研究科
>> >>> > 物理学専攻 宇宙理論研究室 修士課程1年
>> >>> > nakagawa@xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx
>> >>>
>> >>>
>> >>>
>> >>> --
>> >>> Seiya Nishizawa
>> >>> RIKEN Advanced Institute for Computational Science
>> >>> Tel: +81-78-940-5754, Fax: +81-78-304-4972
>> >>> 7-1-26, Minatojima-minami-machi, Chuo-ku, Kobe, Hyogo 650-0047, Japan
>> >>>
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>> Seiya Nishizawa
>> RIKEN Advanced Institute for Computational Science
>> Tel: +81-78-940-5754, Fax: +81-78-304-4972
>> 7-1-26, Minatojima-minami-machi, Chuo-ku, Kobe, Hyogo 650-0047, Japan
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