[dennou-ruby:003614] Re: GPhys::Grib_IO で grib データを読みたい

[Takeshi Horinouchi <horinout@xxxxxxxxxxxxxxxxx>]

堀之内です。

> ruby の1.8 のそれなりのバージョン以降を使っている場合は、

おっと，1.8.x の x が問題？
とりあえず私は 1.8.7 ですが，内藤さんは？
内藤さんが 1.8.7 に変えてOKなら，そういう問題
ですね。

> 西澤です
> 
> gphys に入っている grib パーサーは、
> 元々 ruby で書いていましたが、
> ある時から、 C の拡張ライブラリを利用するように変更しました。
> (おそらく、1.1.0 から)
> 
> 以下、推測も混じっています。
> 
> 内藤さんのエラーは、その拡張ライブラリの中で、
> ファイルから取った文字列の中に、null 文字が埋め込まれている場合に出るものだと思います。
> ruby の1.8 のそれなりのバージョン以降を使っている場合は、
> その拡張ライブラリの中で、 null 文字があってもエラーとならないものを使うようになっているので、
> ruby のバージョンが古いとだめです。
> 詳しくいうと、
> StringValuePtr を使うと問題無いのですが、
> それが無い場合は、STR2CSTR を使います。
> これが問題を起こしているのだと想像します。
> 
> 西本さんがうまくいく原因は、
> 拡張ライブラリを利用する前のバージョンだからでしょう。
> 
> 
> ちなみに、JRA データのエラーは、
> grib2 だからで、
> grib2 を読むためには、ruby-gribapi が必要です。
> 
> 
> 西澤誠也
> 
> 
> 
> 2013年1月18日 16:57 西本絵梨子 <eriko@xxxxxxxxxxxxxx>:
> > 内藤さん
> >
> > Debian lenny なマシンとgphys-1.0.0-1という、とっても古い組み合わせで、
> > チュートリアルのgribデータを読んでみると、成功しました。
> > なので、バージョンが原因ではなさそうです。
> >
> > $ ruby -v
> > ruby 1.8.7 (2008-08-11 patchlevel 72) [x86_64-linux]
> > $ wget http://www.gfd-dennou.org/library/ruby/products/gphys/tutorial/T.jan.grib
> > $ irb
> > irb(main):001:0> require "numru/gphys"
> > => true
> > irb(main):002:0> NumRu::GPhys::Grib_IO.var_names("T.jan.grib")
> > => ["TMP"]
> >
> > debianパッケージをインストールされているようなので、再インストール(aptitude reinstall)してみると
> > 状況がかわったりしないでしょうか?
> >
> > 西本
> >
> > 2013/1/18 Yoko NAITO <naito@xxxxxxxxxxxxxxxxxx>:
> >> 内藤です。
> >>
> >> 堀之内さん、ありがとうございます！
> >>
> >> ▼ GPhys のバージョン
> >> こちらは 1.1.0-3 です。堀之内さんが試してくださったのが 1.2.2 。
> >> 1.2.0 の時に GRIB2 のサポートが加わったようですが関係あるでしょうか？
> >>
> >> ▼ データファイル T.jan.grib
> >> ダウンロードし直して diff を取ってみましたが違いがありませんし、
> >> inspect_varnames.rb の結果も変わりませんね。。。
> >> wget
> >> http://www.gfd-dennou.org/library/ruby/products/gphys/tutorial/T.jan.grib
> >> したのですが、付け忘れているオプションなどあるでしょうか？
> >>
> >> あと書き忘れましたが debian squeeze です。
> >> 引き続き、みなさまのご助言をいただければ幸いです。
> >>
> >> 内藤
> >>
> >> (2013/01/18 13:09), Takeshi Horinouchi wrote:
> >>> 堀之内です。
> >>>
> >>>> 旧チュートリアルから T.jan.grib と contour1000mb_grib.rb を
> >>>> 取ってきて実行すると、下記のようなエラーが出ます。
> >>>
> >>> とりあえずこれについてのみ。
> >>>
> >>> 私のところでは正常に実行できます
> >>> (内藤さんとおなじく ruby 1.8 で， GPhysは 1.2.2)。
> >>> 使ってるGPhysのバージョンはなんでしょう？
> >>> （あまりGPhysのバージョンに左右されそうに
> >>> ないですが）。また，grib ファイルが壊れたりしてませんか。
> >>>
> >>>> 内藤＠京大です。
> >>>>
> >>>> GPhys で grib データを読もうとして、はまっています。
> >>>> JRA-25 のデータを読みたいのですが、それ以前に、
> >>>> 旧チュートリアルにある T.jan.grib がちゃんと読めません。
> >>>> 初歩的な躓きかもしれませんが、アドバイスいただけないでしょうか。
> >>>>
> >>>> 旧チュートリアルから T.jan.grib と contour1000mb_grib.rb を
> >>>> 取ってきて実行すると、下記のようなエラーが出ます。
> >>>> inspect_varnames.rb でも同様です。
> >>>>
> >>>> #----------------------
> >>>> /usr/lib/ruby/1.8/numru/gphys/grib.rb:377:in `to_uint1': string contains
> >>>> null byte (ArgumentError)
> >>>>          from /usr/lib/ruby/1.8/numru/gphys/grib.rb:377:in `version'
> >>>>          from /usr/lib/ruby/1.8/numru/gphys/grib.rb:210:in `parse'
> >>>>          from /usr/lib/ruby/1.8/numru/gphys/grib.rb:1431:in `parse'
> >>>>          from /usr/lib/ruby/1.8/numru/gphys/grib.rb:1411:in `open'
> >>>>          from /usr/lib/ruby/1.8/numru/gphys/gphys_grib_io.rb:80:in `open'
> >>>>          from /usr/lib/ruby/1.8/numru/gphys/gphys_io.rb:121:in `open'
> >>>>          from contour1000mb_grib.rb:3
> >>>> #----------------------
> >>>>
> >>>> また、JRA-25 のデータファイル (たとえば anl_mdl.197901.gr) を
> >>>> inspect_varnames.rb もどき
> >>>> #----------------------
> >>>> require "numru/ggraph"
> >>>> p NumRu::GPhys::Grib_IO.var_names('anl_mdl.197901.gr')
> >>>> p NumRu::GPhys::IO.var_names('anl_mdl.197901.gr')
> >>>> #----------------------
> >>>> で読もうとすると、別のエラーが出ます。
> >>>>
> >>>> #----------------------
> >>>> This Grib version (201) has not supported yet
> >>>> []
> >>>> /usr/lib/ruby/1.8/numru/gphys/gphys_io.rb:257:in `var_names': undefined
> >>>> method `var_names' for nil:NilClass (NoMethodError)
> >>>>          from inspect_varnames_JRA.rb:3
> >>>> #----------------------
> >>>>
> >>>> それぞれ問題が違うような気もするのですが、いずれにしても
> >>>> どうしたらよいかわからなくて困っています。
> >>>> どなたかお知恵を貸してください。よろしくお願いします。
> >>>>
> >>>> ------------------------------------------------------------
> >>>> 内藤 陽子 <naito@xxxxxxxxxxxxxxxxxx>
> >>>
> >>> 堀之内 武
> >>> 北海道大学 地球環境科学研究院 地球圏科学部門
> >>> 〒060-0810 札幌市北区北10条西5丁目
> >>>
> >>
> >
> 
> 
> 
> -- 
> Seiya Nishizawa
> RIKEN Advanced Institute for Computational Science
> Tel: +81-78-940-5754, Fax: +81-78-304-4972
> 7-1-26, Minatojima-minami-machi, Chuo-ku, Kobe, Hyogo 650-0047, Japan

堀之内 武
北海道大学 地球環境科学研究院 地球圏科学部門
〒060-0810 札幌市北区北10条西5丁目